全球基因治療臨床概覽
基因療法從被發(fā)明應(yīng)用,到如今的蓬勃發(fā)展,其進(jìn)程可謂一波三折。隨著越來(lái)越多基因治療產(chǎn)品上市,基因治療的征程已獲得里程碑性勝利。從目前已獲批產(chǎn)品和未獲批的產(chǎn)品臨床試驗(yàn)進(jìn)程來(lái)看,基因治療具有廣闊前景。
PART.1 基因治療的發(fā)展歷史
基因治療的歷史可以分為基礎(chǔ)研究、臨床試驗(yàn)開(kāi)始、蕭條到繁榮以及未來(lái)的發(fā)展這四個(gè)階段(圖1)。下文將對(duì)每個(gè)階段的時(shí)間及發(fā)生的主要事件進(jìn)行詳述。
圖1 基因治療的發(fā)展歷史
基因治療之旅始于Wilhelm Johannsen創(chuàng)造了“基因(gene)”一詞。Francis Crick和James Watson在大約半個(gè)世紀(jì)后發(fā)現(xiàn)了DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)?!盎蚬こ蹋╣enetic engineering)”一詞最早是在20世紀(jì)30年代開(kāi)始使用。在20世紀(jì)60年代,人們發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌中基因轉(zhuǎn)移的基本原理,并根據(jù)這些原理發(fā)展了真核細(xì)胞的基因轉(zhuǎn)移技術(shù)。20世紀(jì)70年代首次描述的限制性內(nèi)切酶和連接酶構(gòu)成了基因操作的基礎(chǔ)。重組DNA技術(shù)使研究人員能夠?qū)⑦x定的治療基因?qū)牍こ梯d體。隨著病毒轉(zhuǎn)移遺傳物質(zhì)的能力被發(fā)現(xiàn),病毒載體逐漸成為一種有前途的基因轉(zhuǎn)移工具。這些技術(shù)進(jìn)步使科學(xué)家成功應(yīng)用基因治療載體將特定遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到靶細(xì)胞從而實(shí)現(xiàn)治療目的。
1.2 臨床試驗(yàn)開(kāi)始階段(1989-2003)
基因治療臨床階段始于1989年,一種逆轉(zhuǎn)錄病毒被應(yīng)用于新霉素耐藥標(biāo)記,用來(lái)追蹤黑色素瘤免疫治療中的浸潤(rùn)性淋巴細(xì)胞。第一次成功的基因治療臨床試驗(yàn)于1990年在賓夕法尼亞大學(xué)啟動(dòng),在一名被診斷為重癥聯(lián)合免疫缺陷?。⊿CID)的四歲女孩體內(nèi)應(yīng)用:該試驗(yàn)使用逆轉(zhuǎn)錄病毒載體將正常拷貝的腺苷脫氨酶(ADA)基因轉(zhuǎn)移到患者的T細(xì)胞后,令機(jī)體產(chǎn)生ADA的能力提高。經(jīng)過(guò)該試驗(yàn),患者病情得以緩解且目前仍然存活。
然而,病毒載體的使用伴隨著隨機(jī)基因插入突變和免疫反應(yīng)等不良事件,這使得基因治療應(yīng)用的步伐開(kāi)始放緩。1999年,一名被診斷為罕見(jiàn)代謝性疾病的18歲男孩,在接受腺病毒載體介導(dǎo)的編碼鳥(niǎo)氨酸轉(zhuǎn)氨酶基因療法后,死于因病毒引起的強(qiáng)烈免疫反應(yīng)及繼發(fā)性多器官衰竭,成為第一個(gè)因基因治療導(dǎo)致死亡的患者。盡管這些不良事件延緩了基因治療的發(fā)展,但也展示出了基因治療對(duì)基因缺陷性疾病的治療潛力。
1.3 從蕭條到繁榮階段(開(kāi)始批準(zhǔn)基因治療產(chǎn)品,2003-2022)
2003年,在經(jīng)過(guò)大約686項(xiàng)臨床試驗(yàn)后,國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)了Gendicine(今又生)上市,這是世界上首個(gè)獲批上市的商業(yè)化基因治療產(chǎn)品。兩年后,國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)了溶瘤病毒產(chǎn)品Oncorine(安柯瑞)上市。2012年,歐洲藥品管理局(EMA)批準(zhǔn)了uniQure公司的AAV基因治療產(chǎn)品Glybera,用于治療脂蛋白脂肪酶缺乏癥LPLD。第一個(gè)干細(xì)胞基因治療產(chǎn)品Strimvelis于2016年獲EMA批準(zhǔn)上市。2017年,美國(guó)食品藥品管理局(FDA)批準(zhǔn)了兩種嵌合抗原受體(CAR)產(chǎn)品Kymriah和Yescarta,成為基因治療藥物發(fā)展史上的關(guān)鍵里程碑,為未來(lái)的基因治療產(chǎn)品研發(fā)上市鋪平了道路。2017年12月,F(xiàn)DA批準(zhǔn)了全球首款A(yù)AV基因治療產(chǎn)品Luxturna,用于治療雙等位RPE65基因突變導(dǎo)致的2型先天性黑蒙癥LCA。2019年5月,F(xiàn)DA批準(zhǔn)了諾華公司的AAV基因治療產(chǎn)品Zolgensma,用于治療2歲以下的脊髓性肌肉萎縮癥SMA,該藥品以其212.5萬(wàn)美元的售價(jià)被稱為“全球最昂貴藥物”。2022年,又有3款A(yù)AV基因治療藥物獲FDA批準(zhǔn)上市,分別是Upstaza、Roctavian和Hemgenix。
1.4 未來(lái)的發(fā)展階段(2022-2025)
隨著多款基因治療產(chǎn)品的成功上市,以及越來(lái)越多的基因治療產(chǎn)品走向臨床,基因治療行業(yè)呈現(xiàn)出井噴式發(fā)展。該文總結(jié)了目前處于申請(qǐng)上市的69款基因治療產(chǎn)品及其適應(yīng)癥(表1)。
表1 待批準(zhǔn)的基因治療產(chǎn)品
PART.2 基因治療的發(fā)展領(lǐng)域
基因療法在多個(gè)領(lǐng)域均發(fā)揮重要作用,作者回顧了2010-2020年的1908項(xiàng)基因治療臨床試驗(yàn)后(圖2),得出的結(jié)論是,目前基因治療的臨床應(yīng)用可分為三個(gè)主要領(lǐng)域:癌癥(Cancer)、單基因或多基因疾?。ㄟz傳性疾病,Genetic Disease)、傳染?。↖nfection)。
2.1 基因治療:一種新興的癌癥治療方法
如圖2C所示,血液系統(tǒng)相關(guān)癌癥的基因治療臨床試驗(yàn)數(shù)量是最多的,其次是胃腸道和神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)癌癥。表2總結(jié)了基因治療領(lǐng)域常見(jiàn)的疾病。白血病、淋巴瘤、黑色素瘤和多發(fā)性骨髓瘤是基因治療領(lǐng)域最常見(jiàn)的癌癥類型。從目前針對(duì)癌癥的臨床試驗(yàn)來(lái)看,大多都處于臨床1期(圖3)。目前為止,已有一些被批準(zhǔn)用于癌癥治療的基因治療產(chǎn)品,如Gendicine、Oncorine、Rexin-G、Imlyga、Delytact和8個(gè)CAR-T細(xì)胞治療產(chǎn)品,包括Kymriah、Yescarta、tecartus、breyanzi、abecma、ARI-0001、carteyva和carvykti。
2.2 遺傳性疾病的基因治療
如圖2D所示,遺傳性疾病的基因治療大多集中在代謝障礙類疾病、眼科疾病和凝血障礙類疾病上。臨床試驗(yàn)數(shù)量最多的遺傳性疾病主要有SMA、DMD、B型血友病、ADA-SCID和β-地中海貧血(表2)。與癌癥相比,遺傳性疾病的基因治療臨床試驗(yàn)處于臨床3期的比例更高(圖3)。這些臨床試驗(yàn)大多是在體內(nèi)進(jìn)行的,AAV是最常用的基因治療載體(圖4)。目前為止,已有一些被批準(zhǔn)用于治療ADA-SCID、DMD、SMA、LCA、β-地中海貧血的基因治療產(chǎn)品上市。
2.3 傳染病的基因治療
如表2所示,AIDS、COVID-19、瘧疾、埃博拉、丙型肝炎、HPV和乙肝是臨床試驗(yàn)數(shù)量最多的傳染病。但從獲批的基因治療產(chǎn)品數(shù)量上來(lái)看,基因治療在傳染病的應(yīng)用上還有很長(zhǎng)的路要走。
圖2 不同疾病類型基因治療的臨床試驗(yàn)數(shù)量
表2 基因治療領(lǐng)域常見(jiàn)的疾病
圖3 按研究階段和疾病類別分類的2010年-2020年臨床試驗(yàn)數(shù)量
PART.3 基因治療的載體
理想的基因治療載體應(yīng)具有高轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、誘導(dǎo)長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá)的能力、靶細(xì)胞特異性、負(fù)載容量等特性。最常見(jiàn)的載體類型是病毒載體。與非病毒載體相比,病毒載體具有更高的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、更強(qiáng)的工程化能力和高度特異性的基因遞送特點(diǎn)。慢病毒和逆轉(zhuǎn)錄病毒主要用于制造CAR-T細(xì)胞和TCR修飾的T細(xì)胞產(chǎn)品。腺病毒載體作為溶瘤病毒產(chǎn)品和病毒疫苗產(chǎn)品而廣為人知。AAV載體因其安全性高、持續(xù)表達(dá)時(shí)間長(zhǎng),免疫原性低、血清型多等特點(diǎn),成為目前最具前景的基因治療載體。
圖4 基因治療臨床試驗(yàn)中使用不同載體的趨勢(shì)
PART.4 小結(jié)
基因治療從首次被認(rèn)為是一種有效的治療方法距今已有30多年的歷史。基因治療被認(rèn)為是難治性疾病的有效方法?;仡櫥蛑委煹陌l(fā)展趨勢(shì),近十年是基因治療產(chǎn)品獲批數(shù)量不斷增加的十年,這意味著我們進(jìn)入了一個(gè)新時(shí)代。并且基因治療策略隨著時(shí)間的推移而演變。遺傳學(xué)及生物技術(shù)的發(fā)展突破,如CRISPR-CAS基因編輯,使基因療法可治療疾病的種類更為廣闊。雖然基因療法主要用于癌癥和遺傳性疾病,但目前也有多款艾滋病、瘧疾和人乳頭瘤病毒等傳染病臨床試驗(yàn)已進(jìn)入臨床晚期研究階段?;蛑委?span style="margin: 0px; padding: 0px; outline: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important;">臨床試驗(yàn)的十年趨勢(shì)分析結(jié)果顯示,以慢病毒、腺病毒和AAV為代表的病毒載體,在臨床中使用廣泛。慢病毒在CAR-T細(xì)胞或TCR修飾的T細(xì)胞產(chǎn)品中廣泛使用,AAV主要用作遺傳性疾病的體內(nèi)基因治療載體。在非病毒載體中,最常見(jiàn)的是RNAs(siRNA、miRNA、shRNA)和質(zhì)粒。在過(guò)去10年,體外基因治療已經(jīng)取得了一定的進(jìn)展,目前的管線眾多。數(shù)據(jù)也顯示,體內(nèi)基因治療將會(huì)在未來(lái)十年迎來(lái)新的發(fā)展高潮。
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本文章來(lái)源于細(xì)胞與基因治療領(lǐng)域